2011 yılında Lazio'dan ayrılarak Galatasaray'ın kapısından girdi. Zoran Simoviç, Faryd Mondragon, Claudio Taffarel gibi onun da Galatasaray'da efsane olacağını düşünenlerin sayısı hiç de az değildi. Beklentileri boşa çıkarmadı. Muslera teker teker kupaları kaldırmakla kalmadı; yabancı oyuncular kategorisinde rekora çoktan koşmaya başladı... Toplamda kazandığı 9 kupayla; Galatasaray'ın en çok kupa kaldıran yabancı futbolcusu efsane Gheorghe Hagi'nin rekoruna bir adım daha yaklaştı.

Fernando Muslera 2011-12, 2012-13 ve 2014-15 sezonlarında lig şampiyonluğu yaşayan kadronun kalesindeydi. 2012, 2013 ve 2015 Süper Kupa finallerinde; 2013-14, 2014-15 ve 2015-16 sezonlarında Türkiye Kupası kaldırılırken kaledeki isim Uruguaylı yıldız isimden başkası değildi... 2013 ve 2014 Süper Kupa, 2013-14 Türkiye Kupası ve 2015-16 Türkiye Kupası finallerinde gol yemeden maçları tamamlayan Muslera; toplamda 9 kupaya ulaştı.

1959 sonrası Galatasaray tarihinde en çok kupa kaldıran isim rekoru Gheorghe Hagi'de bulunuyor. Rumen efsanenin 1996 ile 2001 yılları arasında 1 Süper Kupa, 1 UEFA Kupası, 4 Süper Lig, 2 Cumhurbaşkanlığı (Süper Kupa), 2 Türkiye Kupası bulunuyor. 

Fernando Muslera, 11 Ağustos 2016 tarihinde Beşiktaş ile oynanacak olan Süper Kupa Finali'nde kupayı kaldırırsa Hagi'nin 10 kupalık rekorunu egale edecek.